农产品质量信息管理系统在收集整理农产品生产经营数据和分析影响其质量安全因素的基础上，利用计算机技术对农产品生产加工过程进行管理，使经营企业和消费者可以通过网站查询到农产品生产基地的注册信息、生产资质等，以及农药、肥料和保鲜剂的使用情况。
功能主要包括：农产品基本信息管理；农产品药种植信息管理；农产品加工信息管理；农产品流通信息管理；公告信息管理；系统管理；用户信息查询等。
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